В соответствии с многосторонними соглашениями СНГ созданы следующие межправительственные советы:

- Межправительственный совет по вопросам агропромышленного
комплекса СНГ (1993 г.). Совет формируется из руководителей центральных органов исполнительной власти по вопросам агропромышленного комплекса государств-участников Соглашения о межгосударственных взаимоотношениях в аграрной сфере.

- Координационный совет по карантину растений (1993 г.). В заседаниях Совета участвуют руководители служб карантина растений стран СНГ.

- Межправительственный совет по сотрудничеству в области ветеринарии (1995 г.). В состав Совета входят руководители ветеринарных служб государств-участников Соглашения о сотрудничестве в области ветеринарии.

- Межправительственный координационный совет по вопросам семеноводства СНГ (1996 г.). Совет формируется из полномочных представителей государств, подписавших Соглашение о многосторонней межгосударственной специализации производства и поставок сортовых и гибридных семян сельскохозяйственных культур.

Взаимодействие в рамках СНГ осуществляется через его уставные органы: Совет глав государств, Совет глав правительств, Совет министров иностранных дел, Совет министров обороны, Экономический совет, Совет командующих Пограничными войсками, Межпарламентскую ассамблею, Экономический суд и Исполнительный комитет.

Совет глав государств СНГ - высший орган Содружества, обсуждает и решает принципиальные вопросы политического и экономического направлений, связанных с общими интересами государств-участников.

Совет глав правительств СНГ - координирует сотрудничество органов исполнительной власти в экономической, социальной и иных сферах общих интересов.

Экономический совет СНГ - основной исполнительный орган, обеспечивающий выполнение соглашений, принятых в рамках СНГ, решений Совета глав государств СНГ и Совета глав правительств СНГ о формировании и функционировании зоны свободной торговли, других вопросов социально-экономического сотрудничества. Экономический совет СНГ принимает решения по вопросам, входящим в его компетенцию, а также по поручениям Совета глав государств СНГ и Совета глав правительств СНГ.

При Совете на постоянной основе действует Комиссия по экономическим вопросам, состоящая из полномочных представителей государств СНГ.

Межпарламентская ассамблея государств-участников СНГ координирует вопросы межпарламентского сотрудничества, разрабатывает совместные предложения в сфере сближения и гармонизации законодательных актов государств СНГ.

Исполнительный комитет СНГ - единый, постоянно действующий исполнительный, административный и координирующий орган СНГ. Комитет обеспечивает организацию работы Совета глав государств СНГ, Совета глав правительств СНГ, Экономического совета и других органов Содружества.

К числу руководящих органов Евразийского экономического сообщества (ЕврАзЭС) относятся: Межгосударственный Совет, Интеграционный Комитет, Межпарламентская Ассамблея, Суд Сообщества, Комиссия Постоянных представителей при ЕврАзЭС.

Межгосударственный Совет ЕврАзЭС - высший орган Сообщества. В его состав входят главы государств и главы правительств стран ЕврАзЭС. Совет рассматривает принципиальные вопросы, связанные с интересами государств, определяет стратегию, направления и перспективы развития интеграции и принимает решения по реализации целей и задач ЕврАзЭС.

Интеграционный Комитет ЕврАзЭС - постоянно действующий орган Сообщества. Основные задачи Комитета - обеспечение взаимодействия органов ЕврАзЭС, подготовка предложений по повестке дня заседаний Межгосударственного Совета, проектов решений и документов, а также контроль за реализацией решений, принятых Межгосударственным Советом. Секретариат Комитета осуществляет организацию и информационно-техническое обеспечение работы Межгосударственного Совета и Комитета.

Межпарламентская Ассамблея ЕврАзЭС - орган межпарламентского сотрудничества в рамках ЕврАзЭС, рассматривающий вопросы гармонизации (сближения, унификации) национальных законодательств и приведения их в соответствие с договорами, заключенными в рамках ЕврАзЭС, в целях реализации задач Сообщества.

В соответствии с решением Интеграционного Комитета ЕврАзЭС от 18 июня 2003 г. создан Совет по агропромышленной политике при Интеграционном Комитете ЕврАзЭС. В состав Совета входят министры сельского хозяйства государств Сообщества и по одному из заместителю.